患者病史：
59岁白人女性，每年抽烟60包。2012年5月出现癫痫。磁共振显示病人大脑的前额叶中有一个实性2.6X1.9厘米的肿物，周围有水肿物包围。进一步的18F-FDG-PET成像及CT发现在左腹部有一个2X4 厘米的肿块，标准吸收指数为6。脑部肿瘤标本经病理分析，发现癌变病灶，免疫组化表明CK7及表皮膜抗原呈阳性，甲状腺转录因子-1染色有较弱反应，但是S100，P63及CK20染色均呈阴性。即时定量PCR对特殊编译子的分析 (热点测试‘hotspot testing’) 表明有一个KRAS G12V突变，EGFR正常。分离免疫荧光原位杂交表明ALK重组呈阴性。
患者初始被诊断为原发灶不明的腺癌，并接受了4个周期的卡铂（carboplatin）和多西他赛（docetaxel）治疗。2012年9月，18F-FDG-PET成像检测发现左腹肿块没有明显改变，同时还检测出4.2X2.2厘米大小新的肿块。这个肿块就在原先肿块的边缘，和小肠袢紧密相连无法分离，表明肿瘤已经扩散。
基因检测和分析平台：
FoundationOne平台是进行肿瘤标本检测的靶点分析的新一代测序技术平台（FoundationOne平台，2012版本，Foundation Medicine, 剑桥，美国麻省）。它可以同时分析182个肿瘤相关等位基因的整个编译序列，和14个在肿瘤病人中高频重组基因中的37个内含子的序列，最小覆盖深度为250X。这种分析可以检测到所有类别的基因重组现象（碱基置换，插入或删除，基因拷贝数目变化及重组）。样本组织经过福尔马林固定，石蜡包埋。检测样本组织可小至0.6立方毫米。
基因检测结果及药物治疗:
石蜡包埋组织切片送至CAP公认的、 CLIA认证的Foundation Medicine公司进行基因检测。纯化的肿瘤DNA先被整个编译序列的杂交捕捉（HYBRID CAPTURE），然后对182个肿瘤相关基因的整个编译序列，以及14个在肿瘤中高频重组的基因中37个内含子的序列进行检测。结果表明：该肿瘤组织中MET基因共有16份拷贝，CCND1 有8拷贝，MYC 有9拷贝。KRAS G12V, TP53 R273L 及 CARD11 N184S 高频出现（突变频率分别为27，46，71）。曾经有报道表明MET-扩增的非小细胞肺癌病人(NSCLC) 对克唑替尼（crizotinib）有抗肿瘤反应。基于这个证据，该患者接受了克唑替尼（crizotinib）的治疗（250毫克，口服，每天两次）。随后每三个月进行的扫描表明，在能够承受的剂量范围内，肿瘤组织的反应期超过了19个月。PET－CT扫描表明FDG－高亲和性的腹部肿块完全消失。
结论：
先进完善的基因检测手段使得我们能够检测到预料之外的基因组变化，并采取有效的针对性治疗手段。部分KRAS突变的肿瘤病人无法用针对RTK靶点的方法来治疗。本例患者肿瘤存在MET扩增和KRAS突变，在卡铂（carboplatin）和多西他赛（docetaxel）治疗无效的情况下，对克唑替尼（crizotinib）却有明显的抗肿瘤反应。因此，检测基因突变将是治疗原发灶不明的转移癌的有效手段。
（出处：Palma N,et al. Case Rep oncol 2014;7:503–508）
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