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肿瘤基因检测

癌症基因突变类型,基因融合,基因突变,NTRK基因融合,NTRK突变靶向药

2020-02-12 12:0019299

  癌症基因突变类型,基因融合,基因突变,NTRK基因融合,NTRK突变靶向药

  近年来,癌症治疗已经逐渐向精准治疗迈步。基因检测是实现癌症精准治疗的先行军。医学上,基本上都是采用二代测序(NGS)方式来检测和分析癌症基因突变情况。基因检测包括4种类型,分别是碱基替换、插入和缺失、拷贝数改变和基因融合。另外,其他基因组特征如微卫星不稳定(MSI)和肿瘤突变负荷(TMB)检测也正在被列入某些癌症基因检测中,来指导癌症治疗。

  基因融合是经常导致肿瘤进展的遗传改变,因此是癌症患者很有希望的治疗靶标。肺癌ALK融合突变、ROS1融合突变是研究比较成熟的融合突变,且已经改变了临床治疗的效果。广谱抗癌靶点NTRK融合突变两款靶向药的问世,再次使得越来越多的人关注基因融合突变!

  癌症治疗常见的基因融合突变大盘点

  ALK融合突变

  ALK的融合突变最早报道于1999 年,变性大细胞淋巴瘤中的TPM3-ALK。而目前ALK融合突变检出率最高的是非小细胞肺癌,且也有多种靶向药,辉瑞的Crizotinib(克唑替尼)是最早获得FDA批准的ALK 小分子抑制剂,后来诺华的Ceritinib(色瑞替尼),罗氏的Alectinib(阿来替尼),还有Ariad公司的布加替尼和辉瑞的劳拉替尼等。

  BRAF融合突变

  BRAF的驱动致癌突变主要是BRAF V600E 点突变,在黑色素瘤中占到50%的比例。据美国两家的全基因检测公司纪念斯隆凯特林癌症中心MSK-IMPACT和FoundationOne Heme™ 的数据报道,BRAF的融合突变比例相对较少(0.3%)。虽然靶向BRAF V600E的TKI已经在黑色素瘤上获得FDA批准,但在BRAF融合突变中还没有系统的临床研究,也没有对应的靶向药。

  RET融合突变

  RET基因突变最常见的类型是KIF5B-RET融合,以及CCDC6-RET融合,尤其前者更常见。RET在不同肿瘤中检出比例不同,甲状腺肿瘤比例较高,尤其是甲状腺髓样癌。

  Cabozantinib (卡博替尼)在2012 即获得FDA批准,用于治疗RET融合突变的转移性甲状腺髓样癌。凡德他尼也针对RET融合获批用于治疗甲状腺髓样癌。

  RET融合突变在非小细胞肺癌中的检出率为1-2%,与其他常见突变,如EGFR、ALK、ROS1相互排斥,不会同时出现。在小细胞肺癌中,针对RET融合,靶向药凡德他尼、索拉非尼和舒尼替尼可以抑制肿瘤增殖。

  2020年1月30日,制药巨头礼来公司宣布FDA已受理其抗癌药selpercatinib(LOXO-292)新药申请(NDA)的优先审评,适应症为晚期RET融合阳性非小细胞肺癌(NSCLC)、RET突变型甲状腺髓样癌的患者(MTC)和RET融合阳性甲状腺癌。

  ROS1融合突变

  据统计,肺癌患者中出现ROS1融合的比例在1%-2%之间,常见于年轻的不抽烟的女性肺腺癌患者。对于EGFR和ALK阴性的患者来说,ROS1融合出现的比例高达5%。

  美国FDA于2016年批准克唑替尼可用于ROS1融合的肺癌患者。色瑞替尼针对ROS1融合患者,无进展生存率高达62%,脑转患者无进展生存率达63%。其它的ALK抑制剂也有针对ROS1融合患者的小规模临床试验数据,比如劳拉替尼、Brigatinib和Entrectinib,无进展生存率大概50%-86%。

  针对ROS1融合突变的第一个靶向药就是辉瑞公司研发的赛可瑞(克唑替尼,crizotinib),治疗非小细胞肺癌。今年3月FDA批准广谱靶向药Entrectinib (恩曲替尼),靶向NTRK融合突变的同时也适用于具有ROS1阳性转移性非小细胞肺癌(NSCLC)患者的治疗。

  FGFR融合突变

  FGFR家族包括4个FGFR受体亚型,FGFR1-4,多达18个FGF生长因子配体。与上面提到的ALK,ROS1,RET等相比,FGFR1-4在成人体内起着更重要的生理功能,包括组织、代谢平衡、内分泌、血管生成、伤口愈合等。

  根据美国纪念斯隆凯特林癌症中心MSK-IMPACT基因检测研究报道FGFR1的融合突变比较少见,FGFR1更主要的致癌因素是过量表达。FGFR2的融合突变主要集中在胆管癌。FGFR3 融合突变主要发生在神经胶质瘤,其次是膀胱癌。FGFR4 的融合突变没有检测到。

  针对FGFR1-3的靶向药获批的有白血病的普纳替尼(ponatinib )。

  NRG1融合突变

  神经调节蛋白-1(NRG1)的基因融合突变(约占0.2%的癌症)在多种实体瘤中检测出来。在肺腺癌中最常见的基因融合是NRG1-CD74,且可以用现有的药物靶向治疗,新的靶向治疗也可以有效对抗NRG1融合的癌症。有研究采用GSK2849330单抗靶向治疗和阿法替尼治疗。

  美国凯瑞思一项22000例癌症患者的基因检测研究中发现,NRG1融合发生比例最高的是非小细胞肺癌,但通过RNA测序发现:NRG1基因融合也见于肾癌、胆囊癌、膀胱癌、卵巢癌、胰腺癌、乳腺癌、结直肠癌以及肉瘤和神经内分泌癌中。

  NTRK融合突变

  NTRK家族有3个成员:NTRK1、NTRK2、NTRK3。其表达的相应蛋白叫TRKA、TRKB、TRKC。TRKA的融合突变属于最早发现的实体瘤融合突变之一,最早报道于1986年。

  NTRK融合癌可以发生在人体的任何部位,可以出现在所有实体肿瘤中。在唾液腺肿瘤、胆管肿瘤、肉瘤和甲状腺癌,特别是转移性甲状腺疾病中,NTRK基因融合的出现频率增加。NTRK基因在一些罕见肿瘤中却是常客,包括婴儿纤维肉瘤、唾液腺癌和分泌性乳腺癌癌,发生率高达90%以上。

  NTRK融合广谱抗癌药已上市,无进展生存率高达90%

  No.1、拉罗替尼

  去年11月,Larotrectinib(拉罗替尼)会成为第一个获得FDA批准的“广谱靶向药物”,用于NTRK融合突变的全部实体瘤,包括成年和儿童肿瘤患者。该药物的客观缓解率(ORR)为79%,包含24例完全响应和97例部分响应。另有12%的患者病情稳定,这意味该药物的临床获益率高达91%。

  No.2、恩曲替尼

  今年3月,另一个同类广谱靶向药Entrectinib (恩曲替尼)也获批。在NTRK融合阳性实体瘤患者中,恩曲替尼的客观缓解率ORR(肿瘤缩小)为57.4%,并且在横跨10种不同类型肿瘤中均观察到了客观缓解(肿瘤缩小)。存在脑转移的患者中,恩曲替尼的颅内客观缓解率ORR为54.5%,其中超过1/4实现完全缓解(病灶全部消失)。

  I / II期研究显示,所有携带NTRK、ROS1或ALK融合阳性的儿童肿瘤类型对恩曲替尼治疗的响应率高达100%(完全缓解和部分缓解)!

  检测出NTRK融合突变,有哪些实际价值

  在肿瘤治疗中,如果在第一次治疗中效果不佳,那么第二次治疗的有效性会更低,以此类推。而在临床试验中,1/3的患者是处于3线或更后线的治疗,想象一下,经历了这么多次的治疗耐药和失败,患者及家属肯定已经沮丧到极点。所以,对于那些可能到达4线或者更多其他治疗的患者,NTRK抑制剂这么高的反应率对患者来说真的很有吸引力。

  在临床试验中,还有一个惊人的结果,随着时间的推移,一些部分缓解的患者变成了完全缓解,这说明NTRK抑制剂有一种持续的功效。所以,NTRK融合突变真的是癌症患者的“金券”,手持“金券”真的能跨进长期生存的行列!所以,还是那句话,有条件的癌症患者千万不要错过NTRK融合基因检测!

  拉罗替尼招募信息(免费入组)

  试验名称:

  NTRK融合阳性肿瘤患者口服TRK抑制剂Larotrectinib的 2期临床研究

  适应患者:

  携带NTRK融合的实体瘤儿童或者成年人

  入选标准:

  1.通过分子分析鉴定的NTRK1,NTRK2或NTRK3基因融合的局部晚期或转移性恶性肿瘤

  2.受试者必须事先接受适合于其肿瘤类型和疾病的标准治疗,或者研究者认为,不耐受适当的标准治疗,或者标准治疗无法获益

  3.受试者必须患有至少一个RECIST v1.1定义的可测量病变

  排除标准:

  1.拉罗替尼治疗前情进展,接受了少于28天的治疗并且由于不耐受或毒性而终止治疗的受试者符合入组资格。

  2.有症状或不稳定的脑转移(注意:具有无症状脑转移的受试者有资格参加研究,患有中枢神经系统原发性肿瘤的受试者有资格参加)

  3.不受控制的全身性细菌,病毒或真菌感染,不稳定的心血管疾病或其他会限制研究进行依从性的全身性疾病。

  4.怀孕或哺乳。

  截止日期:2025年9月30日

  申请入组:

  恩曲替尼试验招募(免费入组)

  适应症:携带NTRK1/2/3、ROS1或ALK基因重排突变的局部晚期或转移性实体瘤

  申办方:罗氏(中国)投资有限公司

  入组标准

  1.经组织学或细胞学确诊为局部晚期或转移性实体瘤,而且根据核酸类诊断检测方法进行检测,该肿瘤携带一种预计分别转化成具有一个功能性TrkA/B/C、ROS1或ALK激酶结构域的融合蛋白的NTRK1/2/3、ROS1或ALK基因重排,且不同时存在第二种致癌因素(例如EGFR、KRAS)。

  2.对于通过当地实验室分子检测入组的患者,要求提交存档或新鲜的肿瘤组织(除非存在医学禁忌),在Foundation Medicine, Inc. 或该地区其他认可的中心实验室进行独立中心分子检测。

  3.根据当地采用RECIST v1.1进行的评估,疾病可测量。

  4.无症状或既往接受过治疗并得到控制的CNS累及(包括软脑膜癌病)患者允许入组。

  5.允许既往抗癌治疗(对于肿瘤携带对应基因突变的患者,不包括已批准的或试验用TRK、ROS1或ALK [仅NSCLC患者]抑制剂)。

  6.开始给予Entrectinib治疗时,既往化疗或小分子靶向治疗的用药时间必须至少分别过去2周或5个半衰期(以更短者为准)。

  7.开始给予Entrectinib治疗时,抗体导向治疗的用药时间必须已至少过去4周。

  8.允许给予既往化疗,前提是化疗结束已至少过去14天。接受脑部照射的患者必须在开始给予Entrectinib治疗前至少14天完成全脑放疗,和/或在开始给予Entrectinib治疗前至少7天完成立体定位性放射外科手术。

  9.年龄≥18岁。

  10.东部肿瘤协作组织(ECOG)体力状态≤2且最短预期寿命至少为4周。

  申请入组:

  研究中心所在城市:北京、上海、天津、湖北武汉、浙江杭州、四川成都、黑龙江哈尔滨

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